薬局開設許可の更新手続き完全ガイド

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薬局開設許可とは？薬局開設許可に必要なものを徹底解説
 薬局開設許可申請の要件・条件を徹底解説
 薬局開設許可申請書とその記入例を徹底解説
 薬局開設許可申請に必要書類・チェックリストを徹底解説
 薬局開設許可申請の変更届・更新手続きを徹底解説
 薬局開設許可申請の提出先と手数料を徹底解説

薬局開設許可の更新手続き完全ガイド

1. 薬局開設許可の更新とは

薬局開設許可の更新とは、薬局の開設許可に定められた有効期間満了後も継続して営業するために必要な手続きです。
医薬品医療機器等法に基づき、薬局は有効期間６年間で許可の更新を行う必要があります。

更新手続きを適切に行わない場合、許可の効力が失われる可能性があるため、薬局開設許可の更新は非常に重要な手続きです。

2. 薬局開設許可の更新手続きの基本スケジュール

薬局開設許可の更新は、以下のスケジュールで進めることが推奨されています。

項目	内容
有効期間	6年間
標準処理期間	約7日（保健所管内は10日）
申請時期	有効期間満了の約20日前まで
注意点	年末などは申請集中の可能性あり

行政書士の実務意見として、20日前では遅いケースもあるため、1か月以上前から準備することが望ましいとされています。

３．薬局開設許可の更新・調査対応チェックまとめ

薬局開設許可の更新や立入調査では、構造設備・体制・管理記録の3点が重点確認されます。
以下に、実務で重要なポイントを含めて整理します。

1）構造設備基準の確認

■書籍類の整備

区分	内容	実務ポイント
日本薬局方関連	日本薬局方および解説書	解説書は無料入手不可のため事前購入が必要
薬事法規	薬機法・薬剤師法等の法令集	インターネット保存でも可（網羅性が重要）
調剤技術	調剤指針等	最新版の保持が望ましい
添付文書	医療用医薬品集等	オフライン閲覧可能な状態が必須

■設備・構造の主な確認事項

項目	内容	実務ポイント
進入防止措置	調剤室への立入制限	患者が入れない構造の確認
施錠設備	医薬品保管	鍵付き保管は必須
冷暗所	遮光・温度管理	冷蔵庫の温度記録も確認されることあり
陳列設備	一般用医薬品	区分陳列が必要
掲示物	管理運営・販売制度	掲示漏れが非常に多い

※構造変更がある場合は必ず届出が必要

2）体制省令の確認

項目	内容	実務ポイント
安全使用指針	医薬品安全管理	作成済みであるだけでなく内容が重要
手順書	調剤・情報提供	実態に合っているか確認される

※事前提出が必要なため、未整備は重大な指摘対象

3）管理状況の確認

■基本記録

項目	保存期間	実務ポイント
管理記録簿	3年	記録未記入が多い
研修記録	任意（実質必須）	継続性が重要
医薬品譲受・譲渡記録	3年	直近1か月分は必ず確認される
処方箋	3年	保管場所もチェック対象
調剤録	3年	記載漏れに注意
薬歴	3年	電子保存も可（閲覧性が重要）

■該当する場合の追加記録

項目	保存期間	実務ポイント
第1類医薬品販売記録	2年	対面販売の証跡が重要
毒薬劇薬譲受書	2年	管理不備は重大指摘
登録販売者研修	5年	未受講は違反リスク
特定生物由来製品	20年	長期保存に注意

4）無菌調剤施設

項目	内容	実務ポイント
手順書	無菌調剤対応	実運用と一致必須
クリーン度記録	ISO基準管理	測定記録が必要
研修記録	薬剤師教育	定期実施が必要
機器管理	衛生維持	清掃記録も確認される

5）特定販売（オンライン販売等）

項目	内容	実務ポイント
手順書	販売ルール	内容不備が多い
通信機器	電話・ネット環境	実際に使用可能か確認される

6）健康サポート薬局

項目	内容	実務ポイント
研修修了証	全員分	原本確認あり
事業実績	相談・活動記録	実績不足は指摘対象

7）薬局製剤製造業

項目	内容	実務ポイント
試験機器	顕微鏡・密度計等	実際に使用可能であること
指針	製造業務指針	未整備は不可
記録	製造・販売記録	一貫性が重要
契約書	検査機関	原本確認あり

8）高度管理医療機器等

項目	保存期間	実務ポイント
管理記録	6年	記録漏れ注意
販売・譲受記録	3年〜15年	機器により異なる
研修記録	6年	継続性重視

9）毒物劇物販売業

項目	保存期間	実務ポイント
譲受書	5年	記載不備が多い
SDS	常備	最新版が必要
危害防止規定	必須	未整備は重大指摘
登録確認	販売先確認	証拠保存が必要

まとめ（実務の重要ポイント）

行政書士の実務意見として、特に重要なのは以下です。

書類の存在ではなく「実態との一致」が最重要
直近1か月分の記録は必ずチェックされる
掲示物・手順書の不備が非常に多い
事前準備の有無で調査結果が大きく変わる

薬局開設許可の更新や立入検査では、形式的な書類整備だけでなく、日常業務として適切に運用されているかが厳しく確認されます。
そのため、日頃からの記録管理と定期的な自己点検が不可欠です。

許可証紛失時の対応

許可証を紛失した場合は、紛失理由書を添付すれば更新申請は可能であり、再交付申請は不要とされています。

行政書士の実務意見として、許可証の所在確認は早めに行うことが重要です。直前での紛失発覚は手続き遅延の原因となります。

4. 他の関連許可における更新手続き

薬局開設許可の更新と併せて、他の許可・登録についても更新が必要な場合があります。

各種更新手続き一覧

区分	必要書類	手数料
薬局製剤製造業	申請書・許可証	5,600円
薬局製剤製造販売業	申請書・許可証	4,000円
医薬品販売業	申請書・許可証	11,000円
高度管理医療機器	申請書・許可証	11,000円
毒物劇物販売業	申請書・登録票	6,400円

行政書士の実務意見として、複数許可を同時に更新するケースでは、管理が煩雑になるため一覧化して管理することが重要です。

5. 薬局開設許可の更新時における重要な法改正ポイント

令和元年12月14日の規則改正により、更新申請時の要件として以下が追加されています。

診断書の提出要件

条件	内容
対象	精神機能の障がいにより業務に支障のおそれがある場合
必要書類	医師の診断書
注意点	発行から一定期間内のものが必要

この制度は、薬局業務の適正な運営確保を目的としています。

行政書士の実務意見として、該当性の判断は自己判断せず、事前に行政へ確認することが重要です。

6. 薬局開設許可の更新手続きの流れ

薬局開設許可の更新は、以下の流れで進みます。

有効期限の確認
必要書類の準備
更新申請の提出
行政による審査
許可証の交付

標準処理期間は比較的短いものの、書類不備がある場合は遅延する可能性があります。

7. 薬局開設許可の更新でよくある注意点

更新手続きでは、以下の点に注意が必要です。

注意点	内容
期限管理	満了日を過ぎると失効の可能性
書類不備	記載漏れ・添付漏れが多い
手数料	金額・納付方法の確認不足

行政書士の実務意見として、最も多いトラブルは「期限切れ」です。期限管理は最優先事項となります。

8. 薬局開設許可の更新を確実に行うためのポイント

薬局開設許可の更新を円滑に行うためには、以下の対応が重要です。

有効期限の早期把握
書類の事前準備
許可証の保管確認
行政窓口への事前相談

行政書士の実務意見として、更新手続きは準備がすべてであり、直前対応はリスクが高いとされています。

まとめ

薬局開設許可の更新は、薬局運営を継続するために不可欠な手続きです。
標準処理期間は短いものの、申請期限・書類準備・手数料管理を適切に行う必要があります。

また、法改正により診断書の提出要件が追加されるなど、制度は随時見直されています。
そのため、常に最新の情報を確認しながら、正確に対応することが重要です。

行政書士の実務上の観点からも、早期準備と正確な書類作成が更新成功の鍵となります。

薬局開設許可申請（医薬品店舗販売業許可申請書を含む）は、店舗所在地を管轄する行政機関へ提出します。
申請時は、正本および副本を各1通ずつ提出してください。

指定都市に店舗がある場合の提出先

（神戸市・西宮市・尼崎市・姫路市・明石市）

以下の市内に店舗を開設する場合は、各市の保健所等が申請窓口となります。

提出先一覧

申請先	提出先	所在地	電話番号
神戸市	保健福祉局保健所予防衛生課医務薬務係	〒650-8570神戸市中央区加納町6-5-1神戸市役所1号館6階	078-322-6796
西宮市	西宮市保健所保健総務課	〒662-0855兵庫県西宮市江上町3-26	0798-26-3775
尼崎市	尼崎市保健所保健企画課	〒660-0052兵庫県尼崎市七松町1丁目3-1-502	06-4869-3010
姫路市	姫路市保健所総務課	〒670-0931兵庫県姫路市坂田町3	079-289-1631
明石市	明石市福祉局保健総務課	〒674-0068兵庫県明石市ゆりのき通1-4-7	078-918-5414

上記以外の市町に店舗を開設する場合

（兵庫県所管）

神戸市・西宮市・尼崎市・姫路市・明石市以外に店舗を開設する場合、
申請先は兵庫県となり、店舗所在地を管轄する健康福祉事務所へ提出します。

兵庫県管轄の申請窓口一覧

店舗所在地	申請窓口	所在地	電話番号
芦屋市	芦屋健康福祉事務所	芦屋市公光町1-23	0797-26-8153
宝塚市・三田市	宝塚健康福祉事務所	宝塚市小林3-5-22	0797-72-0054
伊丹市・川西市・川辺郡	伊丹健康福祉事務所	伊丹市千僧1-51	072-785-7463
加古川市・高砂市・加古郡	加古川健康福祉事務所	加古川市加古川町寺家町天神木97-1	079-422-0005
西脇市・三木市・小野市・加西市・加東市・多可郡	加東健康福祉事務所	加東市社字西柿1075-2	0795-42-9372
神崎郡	中播磨健康福祉事務所	神崎郡福崎町西田原235	0790-22-1234
たつの市・宍粟市・揖保郡・佐用郡	龍野健康福祉事務所	たつの市龍野町富永1311-3	0791-63-5145
相生市・赤穂市・赤穂郡	赤穂健康福祉事務所	赤穂市加里屋98-2	0791-43-2937
豊岡市・美方郡	豊岡健康福祉事務所	豊岡市幸町7-11	0796-26-3666
養父市・朝来市	朝来健康福祉事務所	朝来市和田山町東谷213-96	079-672-6871
篠山市・丹波市	丹波健康福祉事務所	丹波市柏原町柏原688	0795-73-3771
洲本市・南あわじ市・淡路市	洲本健康福祉事務所	洲本市塩屋2-4-5	0799-26-2068

まとめ

薬局開設許可申請は、店舗所在地を管轄する自治体または兵庫県の健康福祉事務所へ提出します。提出先は市町村によって異なるため、事前に確認し、正本・副本を揃えて申請することが重要です。薬局開設許可申請を円滑に進めるためにも、適切な窓口への提出を行いましょう。

新規申請前の事前相談について

構造設備が審査基準に適合しない場合、薬局開設許可申請は認められません。
手戻りを防ぐため、工事着工前に必ず事前相談を行ってください。

事前相談の方法

以下の必要書類を添付し、電子メールで提出してください。

提出先メールアドレス
kobe_yakumu※city.kobe.lg.jp
（※を @ に置き換えて送信）

事前相談に必要な書類一覧

書類名	内容
事前相談票	指定様式
建物配置図	施設全体の配置を示す図面
フロアー全体の平面図	建物全体の平面構成
薬局の平面図	薬局部分の詳細な平面図

まとめ文

薬局開設許可申請や更新申請、各種届出は神戸市保健所医務薬務課で受け付けています。来所による申請には窓口予約が必要となるため、e-KOBE（神戸市スマート申請システム）を活用し、事前に手続きを行いましょう。新規の薬局開設許可申請にあたっては、着工前の事前相談が重要です。

手数料について

手数料の概要

薬局開設許可申請においては、手数料として29,000円が必要です。
手数料は、保健所窓口でのキャッシュレス決済、または窓口で交付される納付書を使用した金融機関での納付によりお支払いください。

手数料・納付方法

項目	内容
手数料額	29,000円
更新申請	11,000円
納付方法①	保健所窓口でのキャッシュレス決済
納付方法②	納付書を使用し、金融機関窓口で納付

神戸市収入証紙の取扱い

神戸市収入証紙は2025年3月31日で販売終了
2026年3月31日まで使用可能

納付書を使用する場合の注意事項

納付書を使用して手数料を納付する場合は、金融機関の窓口営業時間の関係上、14時までに保健所窓口へお越しください。

納付書による手数料納付の手順

手続きの流れ

保健所の窓口へ申請書類を持参してください。
　申請書類を確認後、納付書を作成して交付します。
庁舎内等の金融機関窓口にて手数料を納付してください。
　納付後、領収証書を受け取ります。
領収証書を持参し、再度保健所の窓口へ来所してください。
　領収証書を確認した後、申請書類を正式に受付します。

納付手順一覧

手順	内容
①	保健所窓口で申請書類を提出し、納付書を受け取る
②	金融機関窓口で手数料を納付し、領収証書を受領
③	領収証書を持参し、保健所窓口で申請書類を受付

まとめ

薬局開設許可申請では、所定の手数料29,000円を納付する必要があります。
納付方法や納付手順を事前に確認し、金融機関を利用する場合は来所時間に注意することで、薬局開設許可申請を円滑に進めることができます。

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